В один прекрасный день всё население города внезапно исчезает. Такуя, профессиональный наёмный курьер и одинокий волк, встречает Юки, единственную выжившую после исчезновения города. Они полагаются на сообщение отца Юки, который, судя по слухам, пропал без вести, и направляются в исчезнувший город Лост. Перед парой неожиданно возникают препятствия, а реальность сильно шокирует Юки. По пути они сталкиваются с призраками давно ушедших из жизни людей и тайными организациями, действующими в тени. Едва знакомым Такуе и Юки, придётся довериться друг другу на время путешествия, чтобы разгадать тайну города Лост.